يهدف الهيكل التنظيمي إلى تنظيم المستويات الإدارية بما يحقق تنفيذ الأعمال الإدارية والتشغيلية للمؤسسة بشكل متكامل وسلس، وبما يضمن تحقيق الأهداف التأسيسية والتشغيلية لمؤسسة سقاية الأهلية.